ნიუ–იორკის ზოოპარკში კომფორტს შეჩვეული ლომი ალექსის,ზებრა მარტის,ჟირაფ მელმანის და ბეჰემოტ გლორიას იმედები მადაგასკარზე არ გამართლდა, რადგან იქაური ცხოვრება ხიფათებით აღსავსე აღმოჩნდა. მთელი ეს მხიარული კომპანია შემთხვევით აფრიკაში აღმოჩნდება, სადაც ალექსი საკუთარ ოჯახს შეხვდება. ალექსი ხვდება, რომ ზოოპარკში ცხოვრების შემდეგ მას ნათესავებთან ბევრი საერთო აღარ აქვს.